ข้อได้เปรียบหลักๆข้อหนึ่งของไบโอดีเซลคือสามารถใช้กับเครื่องยนต์และอุปกรณ์หัวฉีดน้ำมันที่ใช้อยู่ในปัจจุบันโดยปราศจากผลกระทบในทางลบของ สมรรถนะการทำงาน ธรรมชาตินั้นไบโอดีเซลจะมีเลขซีเธนที่สูง, เป็นเชื้อเพลิงที่มีคุณภาพสูงและ มีการเผาไหม้ที่ยอดเยี่ยม จากคุณสมบัติการหล่อลื่นที่ดีเยี่ยมนั้นทำให้ไบโอดีเซลเป็นเป็นทางเลือกของเชื้อเพลิงทางเลือกเดียวที่สามารถ ยืดอายุการใช้งานของเครื่องยนต์ โดยการลดการสึกหรอของเครื่องยนต์และปั๊มหัวฉีด

ไบโอดีเซลเป็นเป็นทางเลือกของเชื้อเพลิงทางเลือกเดียวที่สามารถลดองค์ประกอบของก๊าซที่ทำให้เกิดปรากฎการณ์เรือนกระจกในชั่นบรรยากาศ ไบโอดีเซลจะ ลดไอเสีย ของคาร์บอนมอนออกไซด์ 50% และคาร์บอนไดออกไซด์ 78% ในวงจรการทำงานสุทธิ ไบโอดีเซลสามารถลดสารไฮโดรคาร์บอน, อนุภาคของดีเซลที่มีอันตรายและฝนกรดที่ทำให้เกิดก๊าซซัลเฟอร์ไดอออกไซด์ นอกจากนี้ยังสามารถขจัดควันที่สามารถมองเห็นได้, กลิ่นที่มีพิษและสามารถสลายตัวได้ง่ายจึงมีอันตรายต่อสิ่งแวดล้อมเพียงเล็กน้อยเท่านั้น

มีโอกาสหลายๆอย่างที่ผู้ผลิต น้ำมันปาล์มในประเทศ จะสามารถช่วยลดการพึ่งพาในการนำเข้าน้ำมันของประเทศไทย, ส่งเสริมความปลอดภัยในด้านพลังงานของประเทศและเพื่อสนับสนุนการพึ่งพาตนเองเพื่อสอดคล้องกับปรัชญาเรื่องเศรษฐกิจพอเพียงขององค์ในหลวง ดังนั้นการซื้อไบโอดีเซลของคุณนั้นจะเป็นการสนับสนุนเศรษฐกิจของประเทศไทย

ไบโอดีเซลนั้นสามารถผสมได้ง่ายและคงสภาพในการผสมเข้ากับน้ำมันดีเซลได้ ดังนั้นจะสามารถเก็บและแจกจ่ายได้ในทุกที่ที่สามารถเก็บหรือขายน้ำมันดีเซลได้ ในการขนย้ายและแจกจ่ายนั้นสามารถใช้อุปกรณ์ (ถัง, ท่อส่ง, ปั๊ม) ที่มีอยู่แล้วได้ในทันที เนื่องจากไบโอดีเซลนั้นไม่มีพิษ, สลายตัวตามธรรมชาติได้และไม่ติดไฟโดยที่มีจุดวาปไฟที่สูงมากจึงทำให้การจัดการและการเก็บนั้นมีความปลอดภัยกว่าเมื่อเทียบกับน้ำมันดีเซลแบบธรรมดา